• facebook
  • linkedin
  • Youtube

Selepas sarjana Amerika Eric S. Lander secara rasmi mencadangkan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) sebagai penanda molekul generasi ketiga pada tahun 1996, SNP telah digunakan secara meluas dalam analisis persatuan sifat ekonomi, pembinaan peta kaitan genetik biologi, dan pemeriksaan gen patogenik manusia., Diagnosis dan ramalan risiko penyakit, pemeriksaan dadah secara individu, dan bidang penyelidikan biologi dan perubatan lain.Dalam bidang pembiakan tanaman tunai, pengesanan SNP dapat merealisasikan pemilihan awal ciri-ciri yang diperlukan.Pemilihan ini mempunyai ciri-ciri ketepatan yang tinggi dan berkesan boleh mengelakkan gangguan morfologi dan faktor persekitaran, sekali gus memendekkan proses pembiakan.Oleh itu, SNP memainkan peranan yang besar dalam bidang penyelidikan asas.

Polimorfisme Nukleotida Tunggal (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) merujuk kepada fenomena bahawa terdapat perbezaan nukleotida tunggal dalam kedudukan yang sama dalam jujukan DNA individu spesies yang sama atau berbeza.Sisipan, pemadaman, penukaran dan penyongsangan asas tunggal semuanya boleh menyebabkan perbezaan ini.Pada masa lalu, definisi SNP adalah berbeza daripada mutasi.Lokus varian memerlukan kekerapan salah satu alel dalam populasi lebih besar daripada 1% untuk ditakrifkan sebagai lokus SNP.Walau bagaimanapun, dengan pengembangan teori biologi moden dan aplikasi teknologi, kekerapan alel tidak lagi menjadi syarat yang diperlukan untuk mengehadkan definisi SNP.Menurut data variasi nukleotida tunggal yang disertakan dalam pangkalan data Polimorfisme Nukleotida Tunggal (dbSNP) di bawah Pusat Maklumat Bioteknologi Kebangsaan (NCBI), sisipan/pepadaman frekuensi rendah, variasi mikrosatelit, dsb.

Pelabelan dan pengesanan molekul SNP1

Dalam tubuh manusia, kekerapan SNP ialah 0.1%.Dalam erti kata lain, terdapat purata satu tapak SNP bagi setiap 1000 pasangan asas.Walaupun kekerapan kejadian agak tinggi, tidak semua tapak SNP boleh menjadi penanda calon yang berkaitan dengan sifat.Ini terutamanya berkaitan dengan lokasi di mana SNP berlaku.

Secara teorinya, SNP boleh berlaku di mana-mana dalam jujukan genom.SNP yang berlaku di rantau pengekodan boleh menghasilkan mutasi sinonim dan mutasi tidak sinonim, iaitu, asid amino berubah atau tidak berubah sebelum dan selepas mutasi.Asid amino yang ditukar biasanya menyebabkan rantai peptida kehilangan fungsi asalnya (mutasi missense), dan juga boleh menyebabkan terjemahan terhenti (mutasi karut).SNP yang berlaku di kawasan bukan pengekodan dan kawasan intergenik boleh menjejaskan penyambungan mRNA, komposisi jujukan RNA bukan pengekodan, dan kecekapan pengikatan faktor transkripsi dan DNA.Hubungan khusus ditunjukkan dalam rajah:

Jenis SNP:

Pelabelan dan pengesanan molekul SNP2

Beberapa kaedah menaip SNP biasa dan perbandingannya

Mengikut prinsip yang berbeza, kaedah pengesanan SNP biasa dibahagikan kepada kategori berikut:

Perbandingan klasifikasi kaedah pengesanan

Pelabelan dan pengesanan molekul SNP3

Nota: Tersenarai dalam jadual pada masa ini, kaedah pengesanan SNP yang lebih biasa digunakan, kaedah pengesanan lain seperti penghibridan tapak khusus (ASH), lanjutan primer tapak khusus (ASPE), lanjutan asas tunggal (SBCE), pemotongan tapak khusus (ASC), teknologi cip gen, teknologi spektrometri jisim, dsb. belum diklasifikasikan dan dibandingkan.

Kos dan masa penulenan asid nukleik dalam beberapa kaedah pengesanan SNP biasa di atas tidak dapat dielakkan.Walau bagaimanapun, kit berkaitan berdasarkan teknologi PCR langsung Foregene boleh secara langsung melakukan penguatan PCR atau qPCR pada sampel yang tidak disucikan, yang membawa kemudahan yang tidak pernah berlaku sebelum ini kepada pengesanan SNP.

Produk siri PCR langsung Foregene secara ringkas dan kira-kira meninggalkan langkah penulenan sampel, yang sangat mengurangkan masa dan kos yang diperlukan untuk menyediakan templat.Polimerase Taq yang unik mempunyai keupayaan penguatan yang sangat baik dan boleh bertolak ansur dengan pelbagai perencat daripada persekitaran penguatan yang kompleks.Ciri-ciri ini memberikan jaminan teknikal untuk mendapatkan produk khusus hasil tinggi. Kit PCR/qPCR Langsung Foregene untuk pelbagai jenis sampel, seperti: tisu haiwan (ekor tikus, ikan zebra, dll.), daun tumbuhan, biji (termasuk polisakarida dan sampel polifenol), dsb.


Masa siaran: Jul-23-2021